Naruto Shippuden the Movie 2 : Bonds Menceritakan tentang penyerangan Desa Konoha oleh Shinobi dari Sorra-Nin (Ninja dari Negeri Langit). Sorra-Nin merupakan ninja yang pernah dikalahkan oleh Konoha ketika perang ninja ke-3. Sisa-sisa shinobi yang selamat dari perang tersebut kembali menuntut balas dan datang serta menggempur Konoha secara habis-habisan. Tsunade yang bertindak sebagai Hokage pada saat itu berusaha mengamankan desa dari serangan Sorra-Nin. Seorang anak perempuan dari desa seberang juga mendapat serangan dari desa Sorra-Nin. Ia datang untuk meminta pertolongan Konoha sekaligus ia mencari Senseinya yang hilang. Akhirnya Tsunade memutuskan untuk mengirim 3 Shinobi untuk membantu anak tersebut.
