Naruto Shippuden the Movie 4 : The Lost Tower Menceritakan tentang 4 Ninja dari Konoha yang sedang menjalankan misi dari Hokage Tsunade. Keempat ninja itu adalah Naruto Uzumaki, Sakura Haruno, Sai dan Yamato. Keempat ninja tersebut ditugaskan untuk menangkap Mukade. Mukade sendiri merupakan missing-nin yang berambisi untuk menguasai 5 Negara Besar dengan cara kembali ke masa lalu. Mukade berniat mengaktifkan kembali kekuatan Ryumkaku untuk menguasai seluruh shinobi di dunia. Ryumkaku merupakan sumber chakra yang sangat besar dan pada masa lalu sudah disegel oleh Hokage ke-4 “Minato Namikaze”. Mukade pun berhasil ke 20 Tahun yang lalu, Naruto dan Yamato tidak tinggal diam dan masuk ke dalam cahaya misterius yang mengantarnya kembali ke 20 Tahun yang lalu. Mampukah Naruto menggagalkan rencana Mukede?.
